La zona era sometida a un intenso pastoreo y quemas periódicas para que el ganado se alimentara de los rebrotes tiernos. Como contrapartida de estos destructivos usos de la zona, se realizaban, desde la década del treinta, prácticas de campo de las cátedras de Botánica de la Facultad de Agronomía de Buenos Aires. Atraídos por los ambientes naturales del área, que ya en esa época eran escasos en cercanías de Buenos Aires, los grupos de estudiantes eran guiados por Ángel Cabrera Y Lorenzo Parodi, dos de los más prestigiosos botánicos argentinos.

Parodi en 1940 ya destacaba la necesidad de proteger la flora de las barrancas y los Bajos de Otamendi, a fin de conservar una de las últimas muestras del paisaje original del noreste bonaerense. Recién en 1990 y por un Decreto Nacional, el área pasa a ser protegida por la Nación, contituyendo la primera Reserva Natural de la APN en la provincia de Buenos Aires.

La retracción del mar, que en tiempos cuaternarios ocupaba una amplia bahía interior ( actualmente Delta y estuario del Paraná) dejó al descubierto el borde de las tierras altas, su antigua costa. Ese límite está a la vista hoy en día en las barrancas, que se continúan al sudeste, paralelas a las costas rioplatense, y donde se desarrollan los Talares y se asentaron las ciudades.

El lecho marino vecino ala costa, forma una terraza baja entre la barranca y el río Paraná. Esta siguió similares procesos de formación a los que experimentados por buena parte de del Delta, enriqueciéndose con los aportes de sedimentos en cada inundación. Si observamos el perfil del relieve a la altura de Otamendi, veríamos que sobre el Paraná de las Palmas tienen forma típica de una isla del Delta, con un albardón costero alto y una zona baja en el centro, que se inunda periódicamente con las crecidas del río.

El albardón está ocupado por una Selva Ribereña o en Galería, con numerosas especies de árboles de estirpe subtropical. En los bajos se instalan numerosas comunidades vegetales acuáticas (juncales, totorales, pajonales, etc. Que son refugio de Carpinchos, Coipos, el injustamente perseguido Ciervo de los Pantanos y una rica avifauna. En los riachos que desembocan en el Paraná, suelen verse Tortugas acuíferas y Lobitos de Río. Sobre los terrenos inclinados de la barranca se asienta una flora y fauna muy diferente, característica de ambientes más secos. Hallamos allí los bosques de Tala, refugio de numerosas aves y pequeños mamíferos. Más arriba, ya sobre la llanura pampeana, se mantiene un sector de pastizal natural, actualmente en recuperación, dado que esas tierras fueron intensamente aprovechas para la agricultura antes de la creación de la Reserva.

En los Terrenos inundables la vegetación dominante es el pajonal, formado por machones compactos de varias especies de hierbas de gran tamaño: Juncos, Totoras, Espadañas, Cortaderas, ect.

En aguas de la Laguna Grande se encuentra una variadísima flora acuática flotante, como Helechitos, Lentejas y Repollitos de Agua. Al pie de la barranca, en los suelos con altos contenidos en sales, prospera el "pelo de chancho" , que en otras zonas de paso a densos Espartillares, entre los que se instalan las esféricas matas de Hunquillo o Hunco, de tallos punzantes. En las pendientes de las barrancas, crece una vegetación de árboles bajos y espinosos llamada Talar, representante del Espinal, expresión empobrecida de los bosques chaqueños del norte del país. El Tala, de dulces frutos naranjas , es una especie dominante, y lo acompañan Ombúes y Espinillos, entre otras especies.

El Sauco, de flores blancas, reunidas en ramilletes, y la Uvilla, con su coloración amarillenta, alegran el sotobosque en primavera. El pastizal Pampeano se asienta en las
zonas más altas, que inundan, en la llamada Pampa Ondulada. Allí encontramos las Frechillas, representantes del pastizal original. Ciertos sectores están dominados por diversas especies de Chilcas y Carquejas.

En las inmediaciones de la Selva Ribereña se guarece el Ciervo de los Pantanos, el ciervo más grande de Sudamérica. Esta especie, debido a al caza desmedida y a la destrucción de su hábitat natural, está a punto de extinguirse.

La avifauna, si bien difícil de ver, pude ser descubierta por un oído entrenado y un ojo atento. Junqueros, Tachuríes Sietecolores y varias especies de Gallinetas y Burritos, entre otros, pueblan el lugar de sonidos.